Bakit kadalasang mas mahusay ang kirurhikong itinanim (invasive) na mga BCI kaysa sa mga nakabatay sa anit?

Mas mahusay ang mga implanted na BCI kumpara sa mga nasa balat ng ulo dahil ang mga electrode nito ay nakalagay direkta sa o loob ng brain tissue, katabi ng mga neuron na gumagawa ng aktibidad, na nagtatala ng mas malinaw na signal. Kailangang basahin ng mga scalp system ang signal sa pamamagitan ng bungo at balat ng ulo, mga layer na nagpapapurol at nagpapahina sa aktibidad, tulad ng pakikinig sa usapan sa pamamagitan ng isang makapal na saradong pinto.

Hindi mas maraming kuryente ang ginagamit ng implanted BCI, at hindi rin talaga kuryente ang salik na nagpapaiba sa kalidad ng signal dito. Hindi rin sila electrode-free; gumagamit sila ng electrode na inilagay sa o loob ng utak sa halip na sa ibabaw ng balat ng ulo.

May kapalit ang mas malinaw na signal na ito: ang paglalagay ng electrode sa utak ay nangangailangan ng tunay na operasyon na may tunay na panganib medikal, kaya't nananatiling kaakit-akit ang mga di-invasive na scalp system kung saan hindi masyadong mahalaga ang perpektong presisyon kumpara sa pag-iwas sa operasyon.